Sincronizar FTP con la twig principal

Ha habido algunos problemas con nuestro website, y los cambios se han realizado directamente en el server web a través de FTP. Sin embargo, usamos gitftp para sincronizar nuestro maestro con nuestro FTP, sin embargo, si queremos actualizar nuestro website ahora, estaremos revocando nuestros cambios hechos a mano. ¿Cuál es una manera fácil de sincronizar todos los cambios realizados en línea con la twig principal de nuestro repository?

Una solución sería usar ftp para recuperar un file del website antes de upload el maestro.

De esta forma, puede descomprimir ese file en su repository local y verificar si hay modificaciones (realizadas en el server activo).
Luego, una vez que esas modificaciones se hayan agregado / fusionado sin conflicto en el repository local, puede usar ftp para cargar el maestro actualizado.