Problemas para desestabilizar, eliminar incluso destrabar un file

Recientemente he clonado un repository privado y he notado que ya tiene un file en etapas que está en estado deleted :

la emisión git status me da esto:

 Changes to be committed: (use "git reset HEAD <file>..." to unstage) deleted: rootfolder/site/templates/article.php 

Quería limpiar este directory de trabajo, el problema surge cuando pierdo la session, desinstalo o incluso elimino, me da un error como el siguiente:

git -c diff.mnemonicprefix = false -c core.quotepath = falso restablecimiento -q HEAD – "rootfolder / site / templates / article.php"

error: ruta no válida 'rootfolder / site / templates / article.php' fatal: make_cache_entry falló para la ruta 'rootfolder / site / templates / article.php'

Cualquier consejo sobre cómo puedo resolver esto, gracias de antemano.