¿por qué mi git usa diferentes files de keys?

Quiero clonar un código fuente en mi server a través de git, así que:

root@wemet:~# ssh-keygen -t rsa Generating public/private rsa key pair. Enter file in which to save the key (/root/.ssh/id_rsa): Enter passphrase (empty for no passphrase): Enter same passphrase again: Your identification has been saved in /root/.ssh/id_rsa. Your public key has been saved in /root/.ssh/id_rsa.pub. The key fingerprint is: 79:ff:5d:07:9f:64:a7:d2:3f:81:0c:4d:ac:54:4e:fe root@wemet The key's randomart image is: +--[ RSA 2048]----+ | oo | | .+o | | . +o | | . o .. | | S . o oE.| | . . +o=o| | o o.=| | o +o| | . +| +-----------------+ root@wemet:~# git clone ssh://git@git.cloudbees.com/foretribe/wetest.git Cloning into 'wetest'... The authenticity of host 'git.cloudbees.com (54.235.125.211)' can't be establis ed. ECDSA key fingerprint is 39:fe:eb:80:cd:56:bb:42:0e:bc:77:85:2c:9b:14:d2. Are you sure you want to continue connecting (yes/no)? no Host key verification failed. fatal: Could not read from remote repository. Please make sure you have the correct access rights and the repository exists. root@wemet:~# 

puedes ver el ssh-keygen generar el file con la huella digital 79: ff: 5d: 07: 9f: 64: a7: d2: 3f: 81: 0c: 4d: ac: 54: 4e: fe pero cuando quiero postularme a el command git la huella del file es: 39: fe: eb: 80: cd: 56: bb: 42: 0e: bc: 77: 85: 2c: 9b: 14: d2

el command git debería recuperar los files de la key ssh por defecto que debe almacenar en /root/.ssh/ ¿por qué el ssh obtiene otro file? ¿donde es?

Eso significa que son files totalmente diferentes.

¿Estás seguro de que quieres continuar conectando (sí / no)? no

Se supone que debes responder "sí" (que agregará ese host a tu file ~/.ssh/known_hosts ).
Esto no tiene nada que ver con tu key pública ssh.

Este no es tu "git usando un file diferente".

Esta es su session ssh pidiéndole que confirme que sabe acerca de este host remoto.
Entonces ssh usará tu key pública.

Un simple ssh -T git@git.cloudbees.com activaría el mismo post (al less hasta que acepte ese host).
(O puede usar ssh-keyscan )