Los files desaparecen cuando se comprometen twigs en Eclipse

Tengo un problema muy serio y realmente necesito ayuda. He estado trabajando en un proyecto de Android usando Eclipse durante un mes, y hace 2 semanas, decidí hacer algunos cambios importantes, así que hice una twig en git (por ejemplo, layout 1). Todo estuvo bien, y he estado trabajando en la nueva sucursal.

Hoy, quería hacer otro cambio importante, así que agregué los files al control de versiones, me comprometí y agregué otra twig (por ejemplo, layout 2), luego me di count de que todos los files junto con mi twig de layout 1 habían desaparecido. ¡Y no pude encontrarlos de todos modos! ¡¿Lo que realmente pasó?!

¿Hay alguna forma de recuperar esos files? Traté de descomprimir el file apk del contenedor, pero no contiene ningún código fuente.

¡¡Por favor, ayúdame!!