La mejor forma de configurar un repository de proyectos multiplataforma de teléfono

¿Cuál es la mejor manera de configurar un repository de plataforma de teléfono multiplataforma (iOS / Android) (git o svn). ¿Cómo se manejan los files / carpetas mutuamente excluyentes dentro de la carpeta www específicamente los files del complemento javascript?

Deberías leer este enlace aquí:

http://docs.phonegap.com/en/edge/guide_cli_index.md.html#The%20Command-line%20Interface

Tiene información realmente buena para instalar una herramienta de línea de command y hacer exactamente lo que estás diciendo. Necesitará node.js instalado (en realidad necesitará su npm que viene con el nodo); si no tiene esto, puede encontrar las instrucciones de installation en el sitio Node.js y también es un proyecto realmente genial. Después de eso, puede crear un proyecto desde la command-line, agregar plataforms, complementos y crear una carpeta de fusiones que puede usar para agregar JavaScript o CSS específicos de la plataforma.