Importar proyecto existente en eclipse, combina automáticamente la versión anterior con la nueva

Quiero importar el proyecto A a Eclipse (GGTS), pero ya tengo A, que es una versión anterior pero del mismo nombre. Cuando uso un proyecto existente de import, combina automáticamente dos versiones juntas, pero no quiero que esto suceda. También uso git, así que no estoy seguro de qué hacer que esto suceda.

Es un error: https://bugs.eclipse.org/bugs/show_bug.cgi?id=40493

Pero puede intentar cambiar la label de nombre en el file .project en el proyecto antes de importarlo.