Fusionar twigs en git en Android Studio

Tengo un problema con la fusión de sucursales en Android Studio. Si quiero fusionar mi maestro local con mi maestro remoto, Android Studio me avisa de que hubo cambios entre el control remoto y el local, y me pide que confirme y presione los cambios. pero cuando bash presionar los cambios, digo que necesito save o esconder los cambios. ¿Hay alguna manera fácil de trabajar con el git en Android Studio?