Eclipse: gran cantidad de conflictos para resolver

Después de la última fusión con la twig principal terminé teniendo un par de cientos de files conflictivos en mi twig. La resolución de conflictos en un solo file es simple. Estoy usando Eclipse, así que solo abro Merge Tool, selecciono 'Comparación bidireccional' en lugar de 'Tres vías', hago clic en 'Copiar todos los cambios no conflictivos de derecha a izquierda', guardo los cambios y los agrego al local repository.

Pero repetir esta operación para unos cientos de files manualmente obviamente no es algo que me gustaría hacer. ¿Hay alguna manera de automatizar este process de todos modos?

Bueno, lo resolví creando una nueva twig de master y moviendo mis cambios a esta nueva twig. Afortunadamente no tuve tantos cambios, así que no fue tan difícil.

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