Convertí las terminaciones de línea, y git-diff dice que todo el file es diferente. ¿Qué he hecho?

¿Es esto normal y debería cometer esto?

Soy consciente de que Git tiene configuraciones para convertir las terminaciones de línea a \n antes de almacenarlas, pero reconfigure mi editor para usar el estilo * nix de manera pnetworkingeterminada (no sé cómo cambió al estilo de Windows), así que convertí todo lo que tenía en mi directory de trabajo, solo para "quedar atrapado".

¿Hay alguna razón para temer?

No es que importe, pero los files son CSS, HTML, PHP, JS, etc.

Git tiene razón. Los diff de Git se basan en si una línea ha cambiado o no, y literalmente cada línea en su file ha cambiado. Eso es lo que sucede cuando conviertes los finales de línea.

No hay motivo para que te preocupes por esto, pero podrías considerar la primera opción que mencionaste: decirle a git que convierta los files a medida que se cometen, dejando solo la copy en tu directory de trabajo.