¿Cómo puedo copyr un directory sin que todos los files aparezcan como "modificados"?

Hace poco .git un directory que contiene .git , en el cual tuve algunas confirmaciones y algunos cambios no declarados.

Cuando abro el directory de copy de security y realizo un git status , todos los files de proyecto aparecen como modified .

No puedo getlo en el mismo estado en que lo respaldé, que es: solo los files que difieren de la última confirmación aparecen como no declarados / modificados.

Alguna pista ?

No sé por qué todos los files aparecen como modificados. Pero si asumimos que esto es una casualidad y que estos cambios no son reales o significativos, entonces una forma de resolver su problema podría ser hacer un git reset :

 git reset --hard HEAD