Cómo evitar que CocoaPods elimine las bibliotecas instaladas previamente

Cuando ejecuto "pod install", CocoaPods elimina todas las bibliotecas que no están incluidas en el file Pod.

El caso en el que deseo que estas bibliotecas no se desinstalen es el siguiente:

Estoy trabajando en un proyecto con muchas sucursales y cada twig tiene sus propias dependencies, por lo que un file Pod diferente, quiero cambiar entre las twigs y no a "Instalar Pod" cada vez que cambio a una twig diferente, a less que tenga una nueva dependencies.