Checkout conflicto con files git pull

Ayer hice una extracción en Eclipse desde el repository de mi equipo y funcionó perfectamente. Pero hoy he intentado tirar y aparece el siguiente post:

Checkout conflict with files: .....(Here is my project and the window that is affected) org.eclipse.jgit.api.errors.ChechoutConflictException 

Uno de mis socios ha hecho cambios pero no al mismo time que yo. ¿Cómo puedo resolverlo?

Usted tiene un conflicto en algún file. Usualmente puedes resolverlo usando algún tipo de herramienta de fusión. Mira este tutorial

Si haces un "estado de git" desde la línea de command obtendrás los files en conflicto, actualiza tu pregunta con la salida para get mejores respuestas.