Registro de errores de Eclipse: no se muestra debido a importado de GIT?

Acabo de empezar a usar la funcionalidad GIT incorporada de Eclipse y tengo todo configurado y funcionando, mi problema ahora es que me di count de que mi proyecto que importé de GIT no informa errores en mi Java como lo haría la copy local. He intentado lo siguiente,

Proyecto -> Limpio

Cuando hago clic derecho en los files de properties de la carpeta, parece que no puedo elegir un Java Builder.

Depende de cómo importe su proyecto Java (administrado por Git) en el espacio de trabajo de Eclipse.
Consulte " Importación de un proyecto de GitHub en Eclipse " como ejemplo.

La key es que su proyecto Eclipse haga reference a las fonts en la carpeta git repo (guardadas fuera de la carpeta del área de trabajo de Eclipse, en el lugar que desee).