Qué hacer con las DLL al implementar en Azure desde el repository de Git

Estoy tratando de implementar una aplicación C # para azure usando un repository git pero falla diciendo:

The type or namespace name 'Mvc' does not exist in the namespace 'System.Web' (are you missing an assembly reference?) 

Actualmente, todas las DLL están excluidas del repository. No quiero include todas estas DLL porque harán que mi repo sea enorme. ¿Hay alguna forma de tener que hacer esto?

Todo lo que necesita hacer es activar Restaurar package NuGet en su solución (haga clic derecho en la solución en VS para encontrar la opción).

Luego puede excluir todos los binarys usando .gitignore. Vea este informe para un ejemplo.